Soanes DM, Chakrabarti A, Paszkiewicz KH, Dawe AL, Talbot NJ (2012) Genome-wide transcriptional profiling of appressorium development by the rice blast fungus Magnaporthe oryzae. PLoS Pathogens 8(2): e1002514.
: 이 연구는 식량자원에 큰 영향을 미치는 벼 도열병균 에 관한 연구로 병을 일으키는데 가장 결정적인 역할을 하는 특화된 침입구조인 부착기 발현과 관련된 유전자들을 밝히기 위한 수행되었다. 부착기는 기주 침입 시 유도되는 특이적인 구조로 병을 일으키는데 결정적인 역할을 한다. 이 연구에서는 부착기가 형성되어 기주에 침입하는 시기까지 샘플을 수집한 뒤 differentially 발현되는 유전자들을 next generation sequencing (NGS)를 이용하여 분석하였으며, 그 결과를 genome wide 수준에서 전사적인 프로파일을 통해 나타냈다. 생성된 NGS 데이터의 정확성을 증명하기 위해 RNA-seq과 high-throughput SuperSAGE 모두를 수행하였다. 이 결과들을 전체 유전자의 패턴 분석을 통해서 나타냈다. autophage, 지질대사 그리고 멜라닌 생합성과 관련된 유전자들을 좀더 자세히 분석하여 부착기 형성 시 이들의 연관성에 대한 증거로서 제시하였다. 이와 더불어 부착기와 관련하여 중요한 global regulator로 알려진 PMK1 MAP kinase의 기능을 밝혔다. 마지막으로 기주 침입 동안 기주의 물질대사를 교란시키는 것과 밀접한 관련이 있는 transporter-encoding 유전자 families와 퀴닌산염의 흡수와 활용에 관련되어 특히 높게 발현되는 유전자들의 differential expression에 관한 증거를 제시하였다. 모든 것들을 종합해 볼 때 이 데이터는 벼 도열병의 생물학을 이해하는 중요한 리소스를 제공할 수 있는 세포질적인 분화와 연관된 유전자 발현의 변화를 comprehensive high-resolution분석을 제공하였다.
