O'Connell RJ, Thon MR, Hacquard S, Amyotte SG, Kleemann J, et al. (2012) Lifestyle transitions in plant pathogenic Colletotrichum fungi deciphered by genome and transcriptome analyses. Nature Genetics. 44(9):1060-1065.
Ohm RA, Feau N, Henrissat B, Schoch CL, Horwitz BA, et al. (2012) Diverse lifestyles and strategies of plant pathogenesis encoded in the genomes of eighteen Dothideomycetes fungi. PLoS Pathogens. 8(12):e1003037.
Leonard G, Richards TA. (2012) Genome-scale comparative analysis of gene fusions, gene fissions, and the fungal tree of life. Proceedings of the National Academy of Sciences USA. 109(52):21402-21407.
: 중요한 식물병원성 진균의 유전체 해독 및 비교유전체 연구가 속속 결실을 맺고 있다. Nature Genetics와 PLoS Pathogens에 발표된 논문에 따르면, Colletotrichum 2종과 Cochliobolus heterostrophus 등 Dothideomycetes 강에 속하는 곰팡이 18개에 대한 유전체를 해독하고 biotrophy, necrotrophy, saprotrophy에 따른 유전체 구조와 진화 및 병원성 전략에 대해 분석하였다. 이들 연구팀이 찾아낸 식물 세포벽 또는 단백질 분해와 이차대사 효소 또는 분비되는 effector 단백질을 암호화하는 유전자들은 병원성에 관련되어 있을 것으로 생각된다. 또한, 영국의 연구진은 다양한 진균의 유전체 서열에서 유전자 결합(gene fusion)을 조사하여 63개를 찾아내고 115종의 곰팡이 유전체에서의 진화 양상을 분석하여 110개의 유전자 분리(gene fission) 현상을 발견하고 이들의 원인으로 separation, degeneration, duplication을 제시하였다. 연구진은 곰팡이의 유전체 진화 계통도로부터 이들 유전자 결합 또는 분리 현상의 패턴을 분석하여 이들이 homoplasy 에 기인할 수 있음을 밝혔다.
