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제 3 총괄과제 : 병원성 유전자 상호작용 및 대사경로 네트워크 구축 |
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제 3-1 세부과제 : 도열병균 병원성 유전자 통합 시스템 구축 및 상호작용 네트워크를 이용한 병원성
in silico 모델 개발 |
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개발된 표준화된 유전체 정보 데이터 웨어하우스와 다양한 병원성 관련 실험 결과를 담고 있는 DB들을 기반으로 벼 도열병균의 병원성 유전자 및 여러 다양한 병원성 곰팡이에 대한 통합 관리 시스템 구축. |
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이 시스템을 기반으로 비교유전체 연구 및 상호작용 네트워크 정보를 첨가하여 곰팡이 병원성에 대한 in slico 모델을 개발하고, 병원성에 대한 시스템생물학적 이해를 시도. |
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제 3-2 세부과제 : 다양한 병원성 곰팡이 종들의 유전자 네트워크 구축 및 응용 |
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생물학적 데이터를 수집·분석·통합하여 시스템 수준의 in silico 유전자 네트워크들을 다양한 병원성 곰팡이들에 대해 구축하고 이를 통해 새로운 병원성 결정 인자 및 조절 경로들을 발굴. |
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제 3-1 세부과제에서 개발된 통합 정보화 시스템을 통하여 수집·정리된 실험 데이터를 여러 가지 알고리즘을 이용하여 분석하고 통합. |
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제 3-3 세부과제 : 병원성 곰팡이 단백질군의 계통분류학적 패턴인식에 의한 기능 예측 |
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유전체의 전체 염기서열이 밝혀진 곰팡이들의 단백질들을 계통분류학적으로 분석하고, 병원성 특이적인 서열상의 패턴을 기계학습 (machine learning) 기법으로 도출하여, 병원성 메커니즘의 진화를 이해하고 궁극적으로는 새로운 항곰팡이제 타깃 발굴. |
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